تشكّلت "كتيبة أبو بكر الصديق" في بلدة ببّيلا جنوب دمشق أواخر عام 2012، وانضمت إلى "لواء أبرار الشام" بتاريخ 24 كانون الثاني/يناير 2013، لكنها ما لبثت أن أعلنت انضمامها إلى "لواء أحفاد الأمويين" في 10 شباط/فبرير 2013.

فصل "لواء أحفاد الأمويين" الكتيبة في بدايات عام 2014 بسبب توافقها مع توجهات تيار "المصالحة" الذي كان يترأسه الشيخ أنس الطويل بعد الاتفاق على هدنة مع قوات النظام في بلدات جنوب دمشق الثلاثة (ببيلا ويلدا وبيت سحم).

إلا أنها انضمت إلى "جيش الأبابيل" في 23 نيسان/أبريل 2016.

خاضت الكتيبة عدة عمليات عسكرية ومعارك ضد قوات النظام والميليشيات الموالية لها في جنوب دمشق، وأسسها "أبو أحمد الزين" والذي تولى قيادتها لفترة وجيزة قبل أن يخلفه "أبو دريد الجرّاح" الذي اغُتيل بتاريخ 13 آب/ أغسطس 2015 داخل أحد مقرات الكتيبة وسط ظروف غامضة، ليتولى شقيقه القيادة بعده حتى شهر أيام/ مايو من عام 2018، حيث انتهى عملها نهائيًا، عندما فّرض التهجير القسري على مناطق جنوب دمشق، وخضع أفرادها إلى ما يسمى "تسوية وضع" والتحوّل إلى طرف قوات النظام.