تأسست في 9 آب/أغسطس 2017 بقرار من محافظة القنيطرة الحرة على أن تكون ممثلاً سياسياً للمحافظة، وضمت الهيئة مجموعة من الفاعليات والمؤسسات والناشطين المعارضين من محافظة القنيطرة وأبناء الجولان في الداخل السوري.

عرفت الهيئة عن نفسها على أنها "كيان سياسي جامع تحت مظلة قوى الثورة والمعارضة، وثوابت الثورة السورية والمصلحة العليا للثورة السورية"، مع تشديدها على أنّ "القرار السياسي لأبناء القنيطرة والجولان ينطلق من الداخل السوري"، وأعلنت الهيئة أن أهدافها هي وحدة الأراضي السورية وتحقيق أهداف الثورة السورية، والحفاظ على ثابتها، والتأكيد أن الجولان عربي سوري، مهما طال الزمن، وهو ملك الشعب السوري.

وأعلنت الهيئة ضمن برنامجها السياسي عن دعم الجيش السوري الحر، واللجنة العليا للمفاوضات، والحكومة السورية المؤقتة، وعن سعيها إلى إقامة دولة مدنية تسودها العدالة والمواطنة.