تشكّلت "كتيبة الشهيد محمد الرفاعي" بتاريخ 26 أذار/مارس 2013 في بلدة طفس بمحافظة درعا، وكان يقودها أبو طارق صبيحي، سميت الكتيبة باسم محمد الرفاعي والذي قٌتل خلال اشتباكات ضد قوات النظام بتاريخ 16 أذار/مارس 2013.

انضمت الكتيبة إلى "لواء الحبيب محمد" فور التأسيس، ثم انضمت إلى "لواء عاصفة الجنوب" بتاريخ 18 شباط/فبراير 2014، ثم انضمت إلى "تجمع أهل حوران" بتاريخ 16 أذار/مارس 2014.