تشكّل اللواء الثاني كتقسيم إداري داخل "فرقة الفاروق المستقلة" بتاريخ 19 تشرين الثاني/نوفمبر 2012، وقاده "عبد الكريم جلّس" الملقب بـ "أبو شاكر".

تكون اللواء من "كتيبة الشهيد محمد خالد مطر" و"كتيبة الشهيد محسن خليف" و"كتيبة الشهيد أبو شهد" و"كتيبة الكهف" و"كتيبة البحر" و"كتيبة الشهيد عبد الله شمس الدين" و"كتيبة السبع" و"كتيبة الوفاء" و"كتيبة خالد الأسعد" و"كتيبة السلس"، وبتاريخ 21 كانون الأول/ديسمبر 2012 انضم للواء "كتيبة الشهيد خضر عمار".

توقف نشاط اللواء بالتزامن مع سيطرة ميليشيا "حزب الله" على مدينة القصير منتصف عام 2013 حيث انسحبت معظم فصائل المنطقة إلى القلمون في ريف دمشق، وانهارت تشكيلاتها أو أعادت تأسيس نفسها أو اندمجت في فصائل أُخرى، أما فرقة الفاروق المستقلة فقد حافظت على كتلة صغيرة من مكوناتها وبايعت تنظيم "داعش" أواخر عام 2014.