تأسست الكتائب في ريف محافظة إدلب في 28 تموز/يوليو 2012، وفي كانون الأول/ديسمبر 2012 انضم الفصيل إلى الجبهة الإسلامية،

اندمج الفصيل مع جيش الإسلام (فرع إدلب) في أيلول/مايو 2015، والذي اندمج بدوره تحت قيادة أحرار الشام في كانون الثاني/يناير 2017

أخيرًا اندمجت كتائب أنصار الشام مع هيئة تحرير الشام في شباط/فيراير 2017.