يقع في مدينة حمص، تحديدا على المدخل الشمالي للمدينة، حيث يطل مباشرة على أوتوستراد حمص حماه، ومدخل الفرع يشرف على دوار سمي باسمه "دوار الجوية".

يتألف من عدة أقسام، منها قسم التحقيق، وقسم المعلومات، وقسم الدفاع الجوي، وقسم القوى الجوية، ويتبع له قسم الدفاع الجوي في محافظة حماة الذي يرأسه العقيد "ناجي الصباغ"، وللفرع مفارز في مدن وبلدات محافظتي حمص وحماه.

يرأس فرع المخابرات الجوية في المنطقة الوسطى العميد "جودت الأحمد"، بينما يشغل العقيد "صايل أسعد داوود" منصب معاون رئيس الفرع، وهو من بلدة فيروزة في الريف الشرقي لمدينة حمص .

ويعتبر الفرع مسؤولا عن العديد من المجازر بحق المدنيين والانتهاكات الواسعة في محافظتي حماه وحمص، ومنها مجزرة الساعة في 19/04/2011، والتي راح ضحيّتها مئات المدنيين.