تم تشكيل الكتيبة في مدينة الميادين شرقي دير الزور بعد عام على انطلاقة الثورة السورية في 21 مارس \ آذار عام 2012، حيث شاركت في العديد من العمليات النوعية في منطقة الميادين.

مطلع يوليو \ تموز عام 2012 اندمجت الكتيبة مع عدد من كتائب الميادين مشكلين (لواء أسود السنة)، حيث شاركت ضمن صفوفه في العديد من العمليات النوعية وعمليات ضرب المقار الأمنية في الميادين، مع تسارع وتيرة العمليات العسكرية التي بدأت تأخذ شكل عمليات تحرير، لتشارك ضمن معارك (تحرير مدينة الميادين - تحرير كتيبة المدفعية في الميادين)

ثم في 11 نوفمبر \ تشرين الثاني عام 2012 وبعد الإعلان عن تشكيل (جبهة الأصالة والتنمية) التي كانت قيادة (لواء أسود السنة) تريد الانضمام إليها، انشقت عدد من الكتائب عن صفوف اللواء منها (كتيبة أسود التوحيد).

مطلع العام 2013 انضمت (كتيبة أسود التوحيد) إلى صفوف (جبهة النصرة) في المنطقة الشرقية، وشاركت ضمن صفوفها منذ ذاك الحين في العديد من المعارك من أبرزها معارك أحياء مدينة دير الزور، كما أرسلت الكتيبة مؤازرة ضمن صفوف (جيش العسرة) الذي شكل في محافظة ديرالزور لنصرة بلدة القصير أواسط العام 2013.

مطلع العام 2014 اندلعت المواجهات في محافظة دير الزور بين الفصائل من جهة وبين (تنظيم الدولة) من جهة أخرى، حيث شاركت الكتيبة ضمن صفوف جبهة النصرة بفاعلية كبيرة في المعارك ضد التنظيم على مدار سبعة أشهر، انتهت بسيطرة تنظيم الدولة على كافة المناطق المحررة من محافظة دير الزور، وانسحاب فصائل الجيش الحر وجبهة النصرة من المحافظة غرباً.

انسحبت (كتيبة أسود التوحيد) ضمن رتل جبهة النصرة الذي توجه إلى محافظة درعا في يوليو \ تموز 2014 حيث شاركت هناك في مواجهات ضد فرع تنظيم الدولة فيها، ثم لاحقاً توجهت مع أرتال النصرة التي تحركت إلى إدلب حيث استقرت ضمن ريف حماة الشرقي ضمن ما عرف باسم (قطاع الشرقية) التابع لجبهة النصرة، حيث ما زال بعض أفراد الكتيبة حتى اليوم في منطقة إدلب ضمن صفوف (جبهة فتح الشام) ثم (هيئة تحرير الشام).